Głównym przeciwnikiem, z którym mierzy się Sonic, po raz kolejny jest wąsaty i przesiąknięty złem doktor Eggman. Przerwał on obchody uroczystości w wodnym mieście, zwanym Soleana i porwał księżniczkę Elise. Całemu wydarzeniu przyglądał się na szczęście nasz bohater, który nie zastanawiając się długo, postanowił wyruszyć jej na ratunek. Graczom przychodzi zwiedzić wraz z nim niemało stopni – są to zarówno podniebne i podwodne krainy, przedziwna dżungla, jak i miasta. Część z nich jest opuszczona i wyniszczona, a na swojej drodze spotykamy tam tylko roboty, nasłane poprzez Eggmana, lecz w niektórych jednak zamieszkują ludzie - Sonic może z nimi rozmawiać, a nawet robić zakupy w specjalnych sklepach, co jest swojego typu nowością w kolekcji. Warto dodać,poziomy nigdy nie były tak rozległe, a lokacje przygotowane są z niesamowitą trosceą o detale. Niektóre etapy można przejść na kilka sposób, podążając wybraną przez siebie drogą. Sonic nie tylko biega (jak przeważnie z zawrotną prędkością), skacze i walczy z przeciwnikami, lecz tym razem zasiada również za sterami pojazdów i na grzbietach dużych zwierząt. Wyraźnie widać dodatkowo, iż jeżyk dojrzał – jest wyższy, a choćby poważniejszy!
W grze pojawiają się w dodatku inne postacie, które występowały w pozycjach z tej kolekcji poprzez ostatnie piętnaście lat, dostępny jest również zupełnie nowy bohater – Silver, który przybył z przyszłości. Sterowanie nim jest zupełnie inne, przede wszystkim dlatego,wyposażono go w zdolności telekinetyczne – może przesuwać i niszczyć na odległość jednocześnie wrogów, jak i fragmenty otoczenia. Ten i inne elementy powodują, że Sonic the Hedgehog niewątpliwie można nazwać grą platformową nowej generacji.